(1)环境饲养环境是影响养殖的一个重要因素，舍内有害气体含量过高对肉鸭的生产和免疫性都能产生显著影响。肉鸭在养殖过程中会产生粪污排放问题，给环境保护带来较大的压力。肉鸭粪便中含有大量的氮、磷、矿物元素及其产生的氨、硫化氢等恶臭气体，严重污染了空气、水体及土壤，破坏了生态平衡，对其中生存的生物体造成了极大危害。除粪便外，兽药常以原形或代谢产物的形式随粪便等排泄物排放到环境中，兽药在土壤中的残留和蓄积，会对土壤微生物等造成不利影响。养殖环境非常复杂，而且始终在变化着，这些变化以各种各样的形式，经由不同的途径，直接或间接地对肉鸭机体产生影响。
(2)品种优良的品种是高产优质的前提和基础。经过二十多年的快速发展，我国的肉鸭生产量已跃居世界首位，然而肉鸭品种及其产品的质量还不容乐观。这主要是由于在发展过程中存在以下问题：一是盲目引进，致使一些劣质品种引进来；其次是我国肉鸭繁育体系还需进步健全，总体投人不够，导致硬件、软件与育种要求有差异：三是利益驱动，追求短期效益，忽视品种的技术含量，以“短平快”推出所谓新品种等，致使我国肉鸭品种质量良莠不齐、优劣并举；四是对传染性疾病的控制力度有待加强，这也严重影响着种群质量。
(3)水质水是构成肉鸭机体最重要的物质之一，水质的优劣也是直接或间接影响肉鸭健康和生产效益的极其重要的因素。水质的优劣可用水质指标来评定，水质指标的项目包括水中的矿物质、水中的物理化学因子，如浊度、酸碱度、溶解氧量、生物需氧量、化学需氧量、氮及磷的含量，以及水中的细菌总含量和大肠杆菌数等。目前在业界尚未制定水质标准。也没有强制规定必须进行水质检测。如果养殖场用水含菌数偏高，甚至有致病菌混于其中，将严重影响肉鸭健康.
(4)饲料一些饲料生产商和养殖企业为了降低生产成本，而寻找些廉价的饲料原料。很可能会将些不符合饲料添加标准的精粕饲料、未经脱毒的矿物原料、不合格的工业下脚料以及未经消毒的其他植物性原料等添加到饲料中。而这些来源杂乱、质量不一的原料，其安全性得不到有效保证。再加上使用过程中对原料的安全性指标没有进行足够重视，对原料中安全卫生指标不清楚，也没有对这些饲料进行相应的质量检验，可能会导致饲料生产安全问题，饲料安全存在隐患。
(5)添加剂饲料添加剂不规范使用主要表现在两方面：一是饲料添加剂的超范围使用；二是没有按规定正确使用饲料添加剂，特别是药物性添加剂。为此，农业部2001年168号公告规定了允许在饲料中长期添加使用的药物添加剂共32个品种，在实际生产中应严格遵守此规定。
(6)药物例如，在饲料生产和养殖过程中使用违禁药品，诸如激素类、催眠镇静类和禁用的抗生素类等药物；在肉鸭正常生长允许范围内超限量添加药物添加剂；不遵守休药期和配伍禁忌等规定，或者在不清楚饲料产品属性的情况下，将不同类型的饲料产品混合搭配饲用，饲料中的药物成分在肉鸭产品中沉淀、残留。
(7)疫病疫病是影响肉鸭健康养殖的重要因素之一。 近年来规模养殖场和养殖小区建设发展迅速，但过分以及片面追求养殖规模的扩大和眼前利益，导致人畜共患病发生，这严重危害着肉鸭和人类的健康。疫病问题的突出，不仅动摇了人们对肉鸭产品消费的信心，也给我国肉鸭养殖业带来巨大的经济损失。
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